Der Fachbereich Migration betreut rund 30 Mitgliedsorganisationen. Das sind zum einen Organisationen, die sich explizit mit den Themen Flucht, Migration und Integration als Hauptschwerpunkt ihrer Arbeit beschäftigen. Zum anderen wenden sich - im Zuge der gesellschaftlichen Veränderungen durch Flucht- und andere Migrationsbewegungen - vermehrt Organisationen aus anderen Fachbereichen, z.B. Bürgerschaftliches Engagement, Behinderung, Kinder und Jugend, der Migration als Querschnittsthema zu. Die vom Fachbereich betreuten Organisationen sind schwerpunktmäßig aktiv in der Migrations- und Asylsozialberatung und im ehrenamtlichen Engagement für Flüchtlinge und Migranten.

Die Mitgliedsorganisationen treffen sich zweimal im Jahr in der Fachgruppe Migration. Dort werden aktuelle Entwicklungen in der Flüchtlings- und Migrationspolitik und Bundes- und Landesprogramme zur Förderung von Migrantinnen und Migranten besprochen.

Der Koordinator für Migration vertritt die Interessen der Paritätischen Mitgliedsorganisationen in unterschiedlichen Gremien wie beispielsweise dem Arbeitstreffen Jugendmigrationsdienste in Bayern und dem Teilbereich Migration der Freien Wohlfahrtspflege Bayern.